Milan Balabán byl autorem řady odborných, esejistických a básnických knih. Ve své tvorbě se věnoval především biblistice, hebrejskému myšlení, religionistice, poezii a otázkám lidské existence.
Výběr z knižní tvorby Milana Balabána
- Kořeny a květy biblických pojmů, EMAN, Benešov, 2012
- Cestami kulhavého Jákoba: deníky z let 1982–1985, Torst, Praha, 2011
- Domov a bezdomoví i jiné zprávy, Pulchra, Praha, 2009
- Jímavé portréty biblických žen: milovnice, trpitelky, bojovnice i kněžky noci, Kalich, Praha, 2009
- Víra (u) Václava Havla: noetický sestřih Havlových Dopisů Olze, OIKOYMENH, Praha, 2009
- Biblický třpyt v české poezii XX. století: ohlasy Nového zákona v české poezii 20. století, spoluautorka Olga Nytrová, OIKOYMENH, Praha, 2007
- Putování k čirému, Zdeněk Susa, Středokluky, 2007
- Hudba pro pozůstalé: básně z doby bolševika, Torst, Praha, 2006
- Kvete-li vinný kmen, Kalich, Praha, 2002
- Tázání po budoucím, spoluautorka Veronika Tydlitátová, Herrmann, Praha, 1998
- Cesty vzhůru, spoluautorka Kateřina Dejmalová, OIKOYMENH, Praha, 1997
- Ohlasy Starého zákona v české literatuře 19. a 20. století, spoluautorka Olga Nytrová, OIKOYMENH, Praha, 1997
- Hebrejské člověkosloví, Herrmann, Praha, 1996
- Bojovníci a trpitelé, EMAN, Heršpice u Slavkova, 1994
- Hebrejské myšlení, Herrmann, Praha, 1993
- Víra – nebo osud?, OIKOYMENH, Praha, 1993
